Zrobiłem płytki poskładałem i znalazłem koszmarne babole :) Poprawiłem na razie kabelkami i teraz się zgadza.
Mam jednak problem, gdyż są tu trzy pliki z wsadami do GALi, niestety nie w wersji wynikowej JED.
http://atari4ever.free.fr/hardware/zip/mach16.zip

Udało mi się uzyskać pliki wynikowe zarówno przy użyciu JEDI:
https://ralfzimmermann.de/software.html#Download

jak również GAL_ASS.TTP, czy wersji PC.
Problem w tym, że pliki wynikowe są zupełnie inne w obu tych programach.

Sprawdzałem obie wersji i tak MACH16 nie działa.

Ogarnia ktoś takie pliki, może są tam błędy ? Miałem już różne wsady, do różnych projektów i nie było takich jajków. Sprawdzę jeszcze raz, czy nie pomyliłem się na PCB.